En 2003, Ackman a fondé la société de gestion de fonds spéculatifs Pershing Square Capital Management. Le hedge fund Pershing Square Holdings (PSH) a rapporté 70% en 2020, contre 58% en 2019. Une mise à jour du portefeuille de février 2021 a révélé certaines positions dans le portefeuille de PSH.
Les principaux contributeurs du hedge fund étaient Lowe’s, Chipotle Mexican Grill, Starbucks et Agilent Technologies, tandis que les principaux détracteurs étaient Berkshire Hathaway, Fannie Mae et Freddie Mac. Pershing Square avait un actif total sous gestion de 13,6 milliards de dollars en février 2021.
En mars 2020, Ackman a affirmé que son entreprise avait fait 2,6 milliards de dollars en pariant correctement que la pandémie COVID-19 provoquerait un krach boursier. La société a liquidé sa position de 1 milliard de dollars dans Berkshire Hathaway de Warren Buffett, selon Forbes.